Исследовательская группа из Университета Хельсинки представляет новое крупномасштабное исследование факторов транскрипции человека, сочетающее два современных метода интерактомики, которые позволяют быстро идентифицировать белок-белковые взаимодействия и обширную функциональную информацию об этом важном семействе генов.
Транскрипционные факторы (ТФ) представляют собой наиболее важную группу белков для клеточного развития, дифференцировки и поддержания гомеостаза. Они управляют сложными паттернами экспрессии генов в клетках на всех стадиях развития. Дефекты в передаче сигналов TF часто приводят к нарушениям развития и заболеваниям.
Однако, несмотря на то, что связывание ТФ с ДНК широко изучено, нам все еще не хватает понимания на системном уровне того, как активность и передача сигналов ТФ контролируются посредством их взаимодействия с несколькими белками, такими как кофакторы, партнеры по димеризации, белки, модулирующие хроматин, ферменты, ингибиторные белки. и общие факторы транскрипции .
Исследовательская группа из Университета Хельсинки решила инициировать большое исследование, чтобы пролить свет на белок-белковые взаимодействия TF и регуляцию TF. Новое исследование опубликовано в Nature Communications .
«Мы представили комплексный интерактомный анализ более 100 ТФ, выявив более 7000 белок-белковых взаимодействий ТФ, большинство из которых находятся в ядре и играют важную роль в регуляции транскрипции», — говорит директор по исследованиям Маркку Варьосало из Института биотехнологии, HiLIFE.
Полученные данные открывают путь для дальнейших исследований регулирования ФТ.
Большое количество взаимодействий TF, обнаруженное в этом исследовании, позволило исследователям провести системный анализ, который выявил группы TF со специфическими биологическими функциями, такими как ремоделирование хроматина и сплайсинг РНК.
«Интересно, что почти половина изученных ТФ взаимодействовала с семейством ТФ ядерного фактора. Известно, что ядерные факторы контролируют множество генов и органогенез во время развития, и их аберрантная активность связана с несколькими типами рака человека. Наши данные показывают, что контроль транскрипции NFI могут регулироваться взаимодействием ядерных факторов с другими TF», — говорит д-р Хелька Гёёс, ведущий автор исследования.
