Микроядра, которые представляют собой небольшие ядерные структуры внутри клеток, обычно связаны с опухолями. Теперь исследователи из Цукуба, Япония, разработали автоматизированную компьютерную программу, которая может точно и воспроизводимо подсчитывать эти структуры по изображениям под микроскопом, что повысит скорость и точность исследования микроядер.
В недавно опубликованном исследовании исследователи из Университета Цукубы сообщили о своей новой программе на основе MATLAB под названием CAMDi (Calculating Automatic Micronuclei Distinction), которая автоматически подсчитывает количество микроядер по изображениям окрашенных клеток. Микроядра можно окрашивать так же, как и обычные ядра, но они отличаются от ядер своим гораздо меньшим размером. Однако их легче сказать, чем сделать, потому что автоматические системы подсчета микроядер традиционно использовали изображения, полученные только с одного уровня ткани. Чтобы понять, почему это важно, представьте, что шар, закрепленный в пространстве, разрезается в поперечном сечении. Если вы отрежете кусочек ближе к верхней или нижней части мяча,
Чтобы решить эту проблему, исследователи из Университета Цукубы сделали фотографии на разных уровнях через клетки или ткани и создали программу, способную анализировать полученную трехмерную информацию. Таким образом они убедились, что то, что программа считала микроядрами, на самом деле было микроядрами. Затем они использовали эту программу для изучения микроядер в нейронах мыши и проверили влияние нейровоспаления на количество микроядер.
«Сообщалось о связи между воспалением и микроядрами в раковых клетках» , - говорит автор исследования доктор Фуминори Цурута. «Мы решили проверить, может ли нейровоспаление в головном мозге повлиять на количество микроядер в нейронах».
Для этого исследователи сначала ввели воспалительные факторы в нейроны мыши, выращенные в культуре, но они не обнаружили изменений в количестве микроядер с помощью своей программы CAMDi. Однако, когда они делали мышам инъекции липополисахаридов, которые вызывали активацию воспалительных клеток в области гиппокампа, наблюдалось увеличение количества микроядер в нейронах гиппокампа.
«Эти результаты были неожиданными», - объясняет д-р Цурута. «Они предполагают, что образование микроядер в нейронах вызвано воспалительными реакциями соседних клеток ».
Учитывая, что микроядра являются маркерами ряда патологий, разработка этой новой компьютерной программы может быть очень важной для диагностики патологий и отслеживания реакции на лечение. Исследования микроядер, чтобы лучше понять их формирование и роль в заболевании, также будут расширены за счет использования CAMDi.
