Представьте, что вы получили положительный результат генетического теста. Врач говорит вам, что у вас есть «патогенный генетический вариант» или последовательность ДНК, которая, как известно, повышает шансы заболеть таким заболеванием, как рак молочной железы или диабет. Но каковы эти шансы — 10 процентов? Пятьдесят процентов? Одна сотня? В настоящее время ответить на этот вопрос непросто.
Чтобы удовлетворить эту потребность, исследователи из Медицинской школы Икана на горе Синай проанализировали последовательности ДНК и данные электронных медицинских карт тысяч людей, хранящиеся в двух огромных биобанках. В целом они обнаружили, что вероятность того, что патогенный генетический вариант действительно может вызвать заболевание, относительно низка — около 7 процентов. Тем не менее, они также обнаружили, что некоторые варианты, например, связанные с раком молочной железы, связаны с широким спектром рисков заболевания. Результаты, опубликованные в JAMA , могут изменить то, как сообщается о рисках, связанных с этими вариантами, и однажды они помогут врачам интерпретировать результаты генетического тестирования .
«Основная цель этого исследования состояла в том, чтобы получить полезную расширенную статистику, которая количественно оценивает влияние, которое известные генетические варианты, вызывающие заболевание, могут оказывать на индивидуальный риск заболевания», — сказал Рон До, доктор философии, доцент кафедры генетики и генетики. Genomic Sciences и член Института персонализированной медицины Чарльза Бронфмана в Икан-Маунт-Синай.
За последние 20 лет ученые обнаружили сотни тысяч вариантов, способных вызывать самые разные заболевания. Однако из-за характера этих открытий было трудно оценить - или предоставить статистику - истинный риск того, что это произойдет для каждого варианта гена. До сих пор большинство оценок было основано на исследованиях с участием небольшого числа субъектов, которые либо были членами семьи, у которой в анамнезе было заболевание, либо были набраны в специализированных клиниках. Но подобные исследования, в которых не используются случайным образом выбранные большие популяции, могут давать завышенные оценки риска, связанного с вариантами.
В этом исследовании исследователи решили эту проблему, проведя крупномасштабный анализ данных секвенирования ДНК 72 434 человек на предмет 37 780 известных вариантов, а затем просканировав записи о состоянии здоровья каждого человека на предмет соответствующего диагноза заболевания. В обширном поиске приняли участие 29 039 участников программы Bio Me Biobank компании Mount Sinai и 43 395 участников, которые были частью UK Biobank.
Исследование проводилось под руководством Иэна С. Форреста, доктора медицинских наук. кандидат в лаборатории доктора До, который черпал вдохновение из предыдущего клинического опыта, который он получил в рамках стипендии после получения степени бакалавра в Национальном институте здравоохранения (NIH).
«Идея исследования возникла в результате мозгового штурма, — сказал г-н Форрест. «Доктор До и я обсудили необходимость улучшения системы классификации риска заболевания. В настоящее время варианты классифицируются с помощью широких ярлыков, таких как «патогенные» или «доброкачественные». Как я узнал в клинике, с этими ярлыками есть много серой зоны. Именно тогда мы поняли, что биобанки, которые связывают данные о последовательности ДНК с электронными медицинскими записями, представляют собой беспрецедентную возможность удовлетворить эту потребность».
