Новая статья в Nature Communicationsописывает, как международная исследовательская группа определила потенциальные возможности для быстрого создания улучшенных и более эффективных соединений для борьбы с COVID-19. Работа является результатом масштабных усилий по скринингу фрагментов с целью разработки противовирусного средства, нацеленного на основную протеазу SARS-CoV-2. Проект возглавил Мартин Уолш, заместитель директора по естественным наукам компании Diamond Light Source; Франк фон Делфт, профессор структурной химической биологии Оксфордского университета и главный научный сотрудник I04-1 / XChem в Diamond; и Нир Лондон, доцент Израильского института Вейцмана. Команда объединила масс-спектрометрию с оборудованием XChem в Diamond, национальном синхротроне Великобритании, чтобы быстро определить новые ведущие соединения для разработки лекарств для лечения COVID-19.
Для этого исследования, называемого скринингом кристаллографических и электрофильных фрагментов основной протеазы SARS-CoV-2 , команда исследовала важный фермент SARS-CoV-2 с более чем 1250 уникальными небольшими соединениями, называемыми фрагментами, и выявила 74 попадания высокоценных фрагментов. которые можно использовать для разработки новых ингибиторов этого важного вирусного белка. В документе подробно описаны данные, а также предложены пути проектирования для продвижения к улучшенным, более мощным соединениям.
«COVID-19, вызванный SARS-CoV-2, не имеет эффективных терапевтических средств. Кроме того, не были разработаны противовирусные препараты или вакцины против близкородственного коронавируса, SARS-CoV-1 или MERS-CoV, несмотря на предыдущие вспышки зоонозов. Определить начало баллов за такую терапию, мы выполнили крупномасштабный скрининг электрофильных и нековалентных фрагментов с помощью комбинированной масс-спектрометрии.и подход с помощью рентгеновских лучей против основной протеазы SARS-CoV-2, одной из двух цистеиновых вирусных протеаз, необходимых для репликации вируса. Наш кристаллографический экран идентифицировал 74 попадания, которые охватывают весь активный сайт, а также три попадания в интерфейс димера. Эти структуры открывают пути для быстрой разработки более сильных ингибиторов и предлагают беспрецедентную информацию о структуре и реактивности для текущего создания лекарств на основе структур против основной протеазы SARS-CoV-2 », - объясняет Мартин Уолш, который помимо своей должности в Diamond также является Совет медицинских исследований (MRC) финансировал руководителя исследовательской группы исследовательского комплекса в Харвелле (RCaH).
