Гепатоцеллюлярная карцинома (ГЦК) является наиболее распространенным типом первичного рака печени. Это одна из ведущих причин смерти от рака во всем мире: ежегодно регистрируется более 700 000 новых случаев и 600 000 смертей от ГЦК. ГЦК чаще всего возникает у людей с хроническими заболеваниями печени, такими как гепатит В, который является одной из основных причин ГЦК (особенно в Азии). В то время как хирургическое вмешательство, трансплантация печени или радиологическое вмешательство могут быть жизнеспособными вариантами для ранней стадии заболевания, прогноз для поздней стадии ГЦК остается мрачным, и большинство пациентов в конечном итоге умирают в течение 20 месяцев после постановки диагноза.
Группа исследователей из Института онкологии Сингапура (CSI Singapore) под руководством профессора Даниэля Тенена и доцента Ивонн Тэй приступила к новому исследованию, целью которого является решение пока неудовлетворенной клинической потребности. Команда определила новые пути, ответственные за ГЦК.
Их выводы были опубликованы в журнале Science Advances 1 октября 2021 года.
Что такое псевдогены?
Команда CSI Singapore сосредоточилась на «псевдогенах» — участке хромосомы, который является несовершенной копией функционального гена. Хорошая метафора понимания различий между ДНК, хромосомами и генами — думать о геноме как о библиотеке. Весь наш геном состоит из множества полок с книгами, каждая из которых инструктирует наше тело производить различные белки, ферменты и другие основные клеточные материалы. Ген — это отдельная книга, содержащая инструкции для конкретного продукта, например, отдельного белка, а последовательности ДНК — это предложения на ее страницах. Хромосома — это полка с книгами, поскольку она содержит много генов, и все полки вместе образуют всю библиотеку (т. е. геном). У человека обычно 23 пары хромосом в каждой клетке.
Каждый раз, когда создается клетка, вся библиотека геномной информации должна быть скопирована в новую ячейку. Во время этого процесса могут возникать ошибки копирования, такие как мутации. Псевдогены описывают этот класс генов: геномные последовательности, похожие на другие гены, но дефектные. Продолжая метафору книги, это книги, содержащие опечатки или опечатки. Псевдогены не кодируют какой-либо белок, но они напоминают гены, которые кодируют, и поэтому называются некодирующими РНК (нкРНК).
Псевдогены когда-то считались нефункциональными эволюционными реликвиями из-за отсутствия у них кодирующего потенциала, но недавно эти нкРНК недавно были связаны с прогнозами пациентов и подтипами рака. Несмотря на потенциальное клиническое значение псевдогенов, на сегодняшний день при раке охарактеризовано лишь несколько из более чем 12 000 псевдогенов человека. В этом исследовании доц. Тэй и ее команда установили ранее непризнанную роль псевдогенов.
