Уротелиальная карцинома (UC) является одной из наиболее распространенных злокачественных опухолей мочеполовой системы, включая уротелиальную карциному верхних мочевых путей (UTUC) и уротелиальную карциному мочевого пузыря (UCB).
UTUC является более злокачественным: у 60% пациентов на момент постановки диагноза наблюдается инвазия в мышцу, по сравнению с 15–25% случаев UCB. Все больше данных свидетельствует о том, что метилирование ДНК тесно связано с прогрессированием опухоли при UCB. Уникальные паттерны метилирования ДНК отличают неинвазивные и инвазивные UCB. Однако профилирование метилирования ДНК при UTUC было ограничено. Сравнительный анализ изменений метилирования ДНК между UTUC и UCB может помочь в разработке диагностики, прогнозирования и даже терапии язвенного колита.
Недавно ученые из Пекинского института геномики Китайской академии наук (Китайский национальный центр биоинформации) и отделения урологии Первой больницы Пекинского университета сообщили об эпигеномных особенностях и профилях UTUC и UCB, идентифицировали подтипы метилирования ДНК с потенциальным риском. стратификацию опухолей и оценили терапевтическую эффективность и мишени ингибитора ДНК-метилтрансферазы SGI-110.
Это исследование, опубликованное онлайн в BMC Medicine , освещает аналогичные стратегии лечения язвенного колита и представляет собой дорожную карту для клинической практики : классификацию подтипов метилирования ДНК можно использовать для прогнозирования исходов у пациентов с язвенным колитом, перенесших резекцию.
Используя метод бисульфитного секвенирования всего генома, ученые обнаружили, что UTUC и UCB имеют очень похожие профили метилирования ДНК, и они охарактеризовали потенциальные связи между метилированием ДНК и клиническими исходами.
Классификация метилирования ДНК выявила два эпикластера, Methy-High и Methy-Low, опухоли Methy-High были гиперметилированы, инфильтрированы иммунной системой и обогащены истощенными Т-клетками с плохим клиническим исходом. Ингибитор ДНК-метилтрансферазы SGI-110 ингибировал миграцию и инвазию клеточных линий Methy-High UC путем усиления множественных противоопухолевых иммунных путей.
Исследование продемонстрировало критическую роль подтипов метилирования ДНК для прогнозирования прогноза пациента с ЯК, предоставив механистическое обоснование для оценки SGI-110 при лечении пациентов с ЯК в клинике.
