Исследователи ПФР, стремящиеся разгадать секреты того, как самый заразный вариант коронавируса стал настолько широко распространенным, нашли интригующий ключ к разгадке.
Компьютерное моделирование позволило исследователям увидеть, как мутации в определенной области дельта-варианта могут помешать антителам полностью закрепиться на вирусе . Эти антитела - полученные в результате вакцинации или борьбы с инфекцией COVID-19 - помогают нашей иммунной системе , прерывая или замедляя коронавирус на различных этапах его процесса проникновения в человеческую клетку и размножения.
Незначительные структурные изменения могут помочь объяснить, почему вариант дельты так заразен.
Открытие было сделано группой исследователей во главе с Премом Чапагейном, физиком, который является заместителем директора Института биомолекулярных наук ПФР, и профессором компьютерных наук Гири Нарасимханом из Школы вычислительных и информационных наук Фонда Найта при Инженерно-вычислительном колледже ПФР. Их исследование было опубликовано в журнале Biochemical and Biophysical Research Communications .
«Дельта-вариант, похоже, нашел спасение», - сказал Нарасимхан. «Немного мутируя, он ослабил действие антитела».
Поскольку структурные изменения, вызванные мутацией, произошли в основном в одной области интерфейса связывания, все еще существует множество других частей вируса, где антитела могут закрепляться и мешать работе вируса должным образом. Вот почему вакцины по-прежнему эффективны против вируса.
«Вирусы не вносят изменений сознательно», - сказал Чапагейн. «Иногда они находят что-то, что будет работать для них лучше, и эти варианты будут более распространенными».
Даже сам дельта- вариант продолжает видоизменяться, поэтому усилия по компьютерному моделированию, подобные тем, которые предпринимаются в ПФР, могут стать ключом к быстрому пониманию того, как ведут себя будущие варианты, или к остановке будущих пандемий на их пути. Вычислительная группа во главе с Нарасимханом использует финансирование Национального научного фонда для обучения компьютеров, которые однажды смогут предсказывать, как будут взаимодействовать белки из антител и вирусов.
На данный момент и Чапагейн, и Нарасимхан призывают людей пройти вакцинацию и носить маски, чтобы обуздать распространение коронавируса и любых будущих вариантов, которые могут распространиться в будущем.
