Исследования, проведенные учеными из Центра вирусных исследований MRC-Университета Глазго и Оксфордского университета в сотрудничестве с UKHSA и Brighton NHS, позволили получить новое представление о трансмиссивности вариантов и восприимчивости к инфекции.
РНК, центральная молекула жизненного цикла SARS-CoV-2, кодирует генетическую информацию, необходимую для создания новых вирусных белков и инфекционных частиц. Поэтому крайне важно понять, как РНК SARS-CoV-2 размножается в инфицированных клетках. В этом новом исследовании, опубликованном в eLife, был разработан новый подход к количественному определению каждой отдельной молекулы РНК SARS-CoV-2 в инфицированных клетках с большей точностью и чувствительностью, чем это было возможно ранее. Такой подход позволил исследователям изучить самые первые стадии инфекции и оценить скорость, с которой разные варианты SARS-CoV-2 реплицируются в клетках в культуре.
SARS-CoV-2, вирус , вызывающий COVID-19, был идентифицирован в конце 2019 года в городе Ухань. С тех пор вирус распространился по всем континентам, вызвав пандемию с миллионами смертей и приведя к глобальному здравоохранению и социально-экономическому кризису. Благодаря активным усилиям исследователей и медицинских работников наши знания об этом патогене накапливались с беспрецедентной скоростью, что привело к успешным программам вакцинации, которые снизили бремя COVID-19. Тем не менее, появление вариантов с повышенной инфекционностью и способностью уклоняться от защитных антител, продуцируемых вакцинацией, является серьезной проблемой в настоящее время.
Исследование показало, что альфа-вариант, обнаруженный несколько месяцев назад в Великобритании, имеет более медленную кинетику репликации, чем исходный вирус, что позволяет предположить, что вызывающие озабоченность варианты SARS-CoV-2 могут отличаться не только по своей способности проникать в клетки, но и по скорость, с которой они умножают свою РНК.
Доктор Альфредо Кастелло сказал: «Большинство внимания было сосредоточено на мутациях, обнаруженных в шиповидном белке вируса, поскольку они могут влиять на способность вируса проникать в клетку или избегать индуцированного вакциной или естественного ответа антител. Однако, мы не должны игнорировать тот факт, что в других вирусных белках происходит множество других мутаций, которые могут влиять на рост и передачу вируса».
Это исследование впервые применило анализ отдельных молекул для изучения репликации SARS-CoV-2 в клетках. Применение этого подхода к другим вызывающим озабоченность вариантам, таким как OMICRON, прольет свет на динамику их репликации и то, как они могут повлиять на клинические результаты.
Профессор Илан Дэвис сказал: «Большинство доступных методов изучения репликации вируса основаны на исследованиях клеточных популяций, предоставляя данные, которые являются средними между всеми клетками в культуре или ткани. Хотя это полезно, это не позволяет нам увидеть различия между клетками. или достаточно подробно изучить жизненный цикл SARS-CoV-2.
«Наш подход превосходит эти «массовые» методы, потому что он предоставляет точную информацию для каждой отдельной клетки с самого первого момента заражения до момента, когда клетка полностью перегружена вирусной РНК. Мы также смогли показать, что метод работает на срезах из инфицированных легких животных, что открывает возможности в будущем для изучения образцов от инфицированных больных».