Сегодня Национальный институт государственной безопасности Квебека (INSPQ) и Центр генома МакГилла объявили о первых результатах своего исследования генетического секвенирования генома SARS-CoV-2, вируса, ответственного за вспышку COVID-19. Согласно исследованию, вирус проник в Квебек во время весенних каникул, и его могли занести в провинцию всего 247 человек. Ожидается экспертная оценка этого предварительного исследования.
«Наше исследование показывает, что вспышка заболевания в Квебеке произошла в основном из Европы и Америки, а не из Азии», - сказал доктор Джесси Шапиро, доцент кафедры микробиологии и иммунологии. «Большинство ранних занесений вируса в Квебек не привели к устойчивой передаче, но шквал интродукций сразу после весенних каникул в конечном итоге привел к появлению десятков тысяч случаев, которые мы наблюдали с тех пор».
Команда секвенировала и проанализировала 734 высококачественных последовательности генома, полученных в период с середины февраля по 1 апреля 2020 года. Последовательности были помещены в контекст 21 935 последовательностей из других мест Канады и других стран, включая все доступные в Глобальной инициативе по совместному использованию всех. Данные о гриппе (GISAID) до 1 апреля. Исследователи искали географическое происхождение различных интродукций, сравнивая результаты эпидемиологических данных истории путешествий с филогенетическим выводом и реконструкцией предкового состояния (также называемой ASR или экстраполяцией назад во времени измеренных характеристик людей на их общих предков. ).
«Мы использовали несколько передовых геномных технологий для секвенирования всего генома SARS COVID-2», - сказал д-р Иоаннис Рагусси, профессор кафедры генетики человека и глава отдела геномных наук Университета Макгилла. «Хотя наши выводы являются предварительными, благодаря этим методам мы можем доверять данным».
