После операции пациенты с раком молочной железы сталкиваются с вопросом, необходима ли дополнительная химиотерапия и действительно ли она эффективна. Важно, чтобы эти женщины не получали слишком много лечения, но и не слишком мало. Физики из Лейпцигского университета смоделировали тесты экспрессии генов и проверили их полезность на основе этих моделей.
Профессор Йозеф Кяс из Лейпцигского университета руководил этими исследованиями в сотрудничестве с главой Института патологии Гамбург-Запад, профессором Акселем Ниндорфом и независимым статистическим консультантом Бернхардом Ульмом. Они только что опубликовали свои выводы в PLOS ONE .
Тесты экспрессии генов исследуют, насколько активны определенные гены в опухолевых клетках. Часто эти гены связаны с характерными признаками рака, такими как рост опухоли или инвазия опухолевых клеток в окружающие ткани. Таким образом, тест экспрессии генов представляет собой метод количественной оценки активности нескольких генов, т.е. список генов, и, таким образом, расчет вероятности того, будут ли и когда у пациента разовьются метастазы.
Результаты этих исследований показывают, с одной стороны, пределы достоверности предсказаний, достигаемых с помощью таких списков генов, и, кроме того, указывают на то, что изучение различных комбинаций списков генов существенно не отличается по результатам. Интересно, что исследователи показали, что даже случайные гены могут иметь прогностическое значение: то есть даже те гены, которые кажутся не связанными с характерными признаками рака.
Здесь, используя классический статистический анализ и новый подход в машинном обучении , физики показали, что такие списки генов на самом деле являются прогностическими в достаточно большом коллективе и показывают высокие соответствия между прогнозом и реальным течением болезни.
Вопреки распространенной в клинической практике рекомендации проводить только один тест, эти списки генов показали, что определенность в отношении рекомендации по химиотерапии намного выше, если проводится более одного теста .
«Тот факт, что тесты очень успешны в коллективе и, как правило, менее успешны для отдельных пациентов, поначалу кажется противоречием, — сказал профессор Кяс, — но эти тесты основаны на списках генов и допускают ошибки в разных точках. , так сказать. Это можно использовать, объединив несколько тестов и тем самым увеличив вероятность обнаружения пациентов, которым химиотерапия точно не поможет».
В условиях продолжающихся дебатов о том, полезны ли тесты на экспрессию генов, это важный вклад в процесс принятия решений, который окажет большое влияние на то, как клиницисты используют такие инструменты. В частности, для отдельных пациентов эти результаты подразумевают, что при использовании тестов экспрессии генов требуется осмотрительность.
Ограничением с методологической точки зрения является то, что исследователи не проводили коммерчески доступные тесты; анализы основаны на значениях экспрессии генов, зарегистрированных в общедоступных базах данных рака молочной железы.
