Исследователи из Центра геномной регуляции (CRG) определили несколько белков, участвующих в развитии меланомы, самой смертельной формы рака кожи. Было обнаружено, что один из белков — PDIA6 — особенно важен для развития злокачественных новообразований. Эксперименты на мышах показали, что клетки меланомы со сниженным уровнем PDIA6 обладают нарушенной способностью к метастазированию в легкие.
Исследователи обнаружили, что PDIA6 способствует злокачественному новообразованию меланомы, связываясь с молекулами РНК внутри опухолевой клетки. Авторы исследования, опубликованного в журнале Nucleic Acids Research при поддержке фонда «La Caixa», определили область на поверхности PDIA6, которая связывается с молекулами РНК. При дальнейших исследованиях эта информация может помочь в разработке новых терапевтических соединений, предотвращающих распространение меланомы из одной части тела в другую.
Ранее PDIA6 связывали с прогрессированием лимфомы, рака молочной железы и легких . Если дальнейшие исследования обнаружат, что PDIA6 также связывается с РНК при этих других типах рака , это может привести к терапевтической стратегии, нацеленной на один и тот же механизм действия при разных опухолях.
Открытие стало возможным благодаря методу «вылова РНК», специально разработанному для идентификации РНК-связывающих белков. Это класс белков, которые выполняют множество биологических функций, а при раке придают клеткам устойчивость, помогая им адаптироваться к изменяющимся условиям и быстро реагировать на внешние угрозы, способствуя злокачественности рака и устойчивости к терапии.
Этот метод, также известный как захват интерактома РНК, включает в себя вылов всех матричных РНК в клетке. Затем исследователи видят, какие белки к ним присоединены, что дает информацию об уровне и разнообразии РНК-связывающей активности, происходящей внутри клеток.
«РНК-связывающие белки представляют большой терапевтический интерес. Техника этого исследования может помочь нам измерить их активность, что невозможно в таком глобальном масштабе с помощью обычных методов. При использовании для сравнения опухолевых и неопухолевых клеток этот подход помогает нам идентифицировать какие белки могут играть важную роль в прогрессировании рака, и проведение дальнейших экспериментов покажет нам, как они работают Мы использовали этот план для выявления новых уязвимых мест в меланоме, и мы надеемся, что его можно будет повторить, чтобы найти новые терапевтические мишени и для других видов рака. », — объясняет доктор Фатима Гебауэр, научный сотрудник CRG и старший автор исследования.
Из сотен РНК-связывающих белков, идентифицированных с помощью этого метода, исследователи выбрали 24 для проведения дальнейшего анализа с использованием различных критериев, например, потому что их РНК-связывающая активность не была описана или они ранее не были связаны с прогрессированием рака. Исследователи выделили PDIA6 для дальнейшей характеристики его функции, включая эксперименты по трансплантации на моделях мышей. Будущие исследования могут углубиться в изучение роли других 23 найденных белков.
«Мы всего лишь касаемся поверхности потенциала РНК-связывающих белков в качестве терапевтических мишеней. Идентификация РНК-связывающей активности с помощью функциональных методов с последующим подробным молекулярным пониманием их возможностей проложит путь к разработке ингибиторов, которые могут значительно улучшить персонализированная терапия рака », — заключает доктор Гебауэр.
