В первые дни пандемии, когда коммерческих тестов на COVID не хватало, Роберт Б. Дарнелл из Университета Рокфеллера разработал собственный тест для выявления положительных случаев в сообществе Рокфеллеров. Оказалось, что это проще и безопаснее проводить, чем тесты, доступные в то время, и за последние девять месяцев его использовали десятки тысяч раз для выявления и изоляции инфицированных людей, работающих в университетском городке.
Теперь новое исследование в PLOS ONE подтверждает, что тест Дарнелла работает так же, если не лучше, чем одобренные FDA назальные и оральные мазки. При прямом сравнении 162 человек, которые прошли и тест слюны «DRUL» Рокфеллера, и обычный мазок, DRUL выявил все случаи, которые были определены как положительные, плюс четыре положительных случая, которые мазки полностью пропустили.
«Это исследование подтверждает, что разработанный нами тест чувствителен и безопасен», - говорит Дарнелл, профессор Роберта и Харриет Хейлбрунн и руководитель лаборатории молекулярной нейроонкологии. «Он недорогой, обеспечивает отличное наблюдение в сообществе Рокфеллеров и может повысить безопасность в сообществах по мере затягивания пандемии».
Ответ на мазки из носа
Тестирование на COVID-19 было кошмаром в первые дни пандемии. Пациенты с лихорадкой подсовывали покрытые микробами маски под нос и готовились к тому, чтобы медработники вонзали мазки глубоко в каждую ноздрю. Медсестры рисковали подхватить болезнь при каждом взмахе мазка; Техники опасались обращаться с пузырьками, заполненными транспортной средой, предназначенной для сохранения вирусов. А потом наступила нехватка. Внезапно у нас закончились тампоны, перчатки, маски, среда. Вирус бушевал.
Тест DRUL дает несколько преимуществ. Это было безопасно - тест, который можно было пройти дома и отправить в лабораторию в транспортной среде, убивающей вирус при контакте. Это было эффективно. В тесте использовались только готовые к продаже реагенты, и не хватало других программ. Это было недорого, около 2 долларов за тест. (Для сравнения, Medicare в настоящее время платит до 100 долларов за каждый проведенный коммерческий тест.) И это было удобно. Чтобы получить образец, просто плюнули в чашку.
Данные этого исследования, которое ранее было отправлено в штат Нью-Йорк в рамках процесса утверждения, показывают, что DRUL соответствует и в большинстве случаев превосходит широко используемые тесты, с которыми он сравнивался.
Сначала исследователи оценили предел обнаружения DRUL - сколько вирусных копий тест может уловить на один объем жидкости. Тесту удалось обнаружить одну вирусную частицу в одном микролитре слюны, что сопоставимо с показателями самых чувствительных тестов. Затем лаборатория провела 30 мазков из носа, которые дали положительный результат на COVID-19, через свою новую платформу для тестирования. ДРУЛ поймал все 30.
Затем, в ходе прямого испытания, команда Дарнелла сравнила 162 результата добровольцев, получивших мазок и анализ слюны. Как и ожидалось, почти все результаты оказались отрицательными. Но четыре образца, которые были отрицательными или неопределенными в мазке, были положительными в анализе DRUL, и действительно, три из этих образцов принадлежали добровольцам, у которых развился симптоматический COVID.
Тестирование для всех
За месяцы, прошедшие с тех пор, как он был одобрен в качестве клинического диагностического теста в штате Нью-Йорк, DRUL широко использовался в кампусе, сначала для избранных основных сотрудников, а затем в качестве еженедельной программы скрининга в лаборатории Дарнелла, которая позволила Центру детей и семьи Рокфеллера для дети сотрудников благополучно откроются к лету 2020 года.
«CFC была пилотной программой, демонстрирующей, что мы можем использовать тест для еженедельных просмотров» , - говорит Вирджиния Хаффман, вице-президент по кадрам в Rockefeller. Это сработало. «Мы были открыты в течение четырех месяцев со 150 студентами на месте и ни одного положительного результата», - добавляет Памела Старк, директор CFC. Когда в декабре появился первый положительный случай, лаборатория Дарнелла и CFC координировали отслеживание контактов и стратегический карантин. Больше никто не был заражен.
Хаффман и Старк вместе с несколькими аспирантами лаборатории Дарнелла являются соавторами исследования.
С помощью теста DRUL в Рокфеллер было проведено более 65 000 тестов, и этот тест стал стандартным еженедельным скринингом для всех сотрудников Рокфеллера на территории кампуса. Другие группы также внедрили тест, в том числе ученые из исследовательского кампуса Медицинского института Говарда Хьюза, Stop COVID-19 и интегрированной системы здравоохранения Нью-Йорка. Дарнелл также поделился своим протоколом тестирования с коллегами из Вашингтонского университета, Калифорнийского университета в Беркли, Колумбийского университета, Университета штата Мичиган, Массачусетского технологического института и Института Макса Планка.